El estudio de Kojima Productions es responsable de la producción.

Los orígenes del ciclo, cuyo fundador y director es Hideo Kojima, se remontan a 1987. Consta de varias partes principales y muchos títulos secundarios. La historia de todos está conectada y presenta diferentes perspectivas sobre los eventos que tienen lugar a lo largo de varios años.

El protagonista principal de Metal Gear Solid 5: The Phantom Pain es Punished Snake (también conocido como Big Boss), uno de los personajes clave del universo de Metal Gear, que es bien conocido por los veteranos de la serie, gracias a Metal Gear Solid: Peace Walker entre otros. Se despierta después de nueve años en coma, que fue el resultado de heridas sufridas, incluida la pérdida de su mano izquierda.

Los eventos que lo llevaron a este estado se presentan en el prólogo del juego titulado Ground Zeroes. Poco después de recuperar la conciencia, el hospital en el que reside Snake es atacado por atacantes armados y el protagonista debe huir. Él es ayudado por un paciente misterioso con una cara velada, apareciendo como Ishmael.